《阿弥陀经》说，若有善男子善女人闻说阿弥陀佛，执持名号，从一日乃至七日能够一心不乱，此人临命终时心不颠倒，即得往生西方极乐世界。《药师如来本愿功德经》等所说的东方药师佛居住教化的琉璃世界，也是佛教徒所向往的理想国土。那里的地面由琉璃构成，连药师佛的身躯，也如同琉璃一样内外光洁，所以称琉璃世界。佛经上说此世界和西方极乐世界一样，具有说不尽的庄严美妙；那里没有男一女一性一别上的差异，没有五欲的过患；琉璃为地，金绳界道；城垣、宫殿都是七宝所成。人们只要在生前持诵《药师经》[称念药师佛名号，并广修众善，死后即可往生琉璃世界。
十二大愿
药师佛药师如来在过去世行菩萨道时，为救度众生而发十二大愿如下：
第一大愿
愿我来世得阿耨多罗三藐三菩提时，自身光明炽然，照耀无量无数无边世界。以三十二大丈夫相、八十随形好庄严其身，令一 切有情，如我无异。
第二大愿
愿我来世得菩提时，身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明广大，功德巍巍，身善安住，焰网庄严，过于日月，幽冥众生，悉蒙开晓，随意所趣，作诸事业。
第三大愿
愿我来世得菩提时，以无量无边智慧方便，令诸有情，皆得无尽所受用物，莫令众生有所乏少。
第四大愿
愿我来世得菩提时，若诸有情行邪道者，悉令安住菩提道中；若行声闻、独觉乘者，皆以大乘而安立之。
第五大愿
愿我来世得菩提时，若有无量无边有情，于我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒。设有毁犯，闻我名已，还得清净，不堕恶趣。
第六大愿
愿我来世得菩提时，若诸有情其身下劣，诸根不具，丑陋顽愚、盲聋喑哑、挛躃背偻、白癞颠狂种种病苦，闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦。
第七大愿
愿我来世得菩提时，若诸有情，众病一逼一切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦，我之名号，一经其耳，众病悉除，身心安乐，家属资具，悉皆丰足，乃至证得无上菩提。
第八大愿
愿我来世得菩提时，若有女人，为女百恶之所一逼一恼，极生厌离，愿舍女身，闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相，乃至证得无上菩提。
第九大愿
愿我来世得菩提时，令诸有情出魔罥网，解脱一切外道缠缚；若堕种种恶见稠林，皆当引摄置于正见，渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提。
第十大愿
愿我来世得菩提时，若诸有情王法所加，缚录鞭挞。系闭牢狱。工当刑戮及余无量灾难凌一辱。悲愁前一逼一。身心受苦。若闻声名。以我福德威神力故皆得解脱一切忧苦。
第十一大愿
愿我来世。得菩提时。若诸有情。饥一渴所恼。 为求食故。造诸恶业。得闻我名。专念受持。我当天以上妙饮食饱足其身。后以法昧毕竟安乐。而建立之。
第十二大愿
愿我来世得菩提时。若诸有情，贫无衣服，蚊虻寒热，昼夜一逼一恼，若闻我名，专念受持，如其所好，即得种种上妙衣服。亦得一切实庄严具。华鬘涂香，鼓乐众伎，随心所玩，皆令满足。
功德利益
一：药师法门以读诵《药师琉璃光如来本愿功德经》，念药师咒，念南无药师琉璃光如来名号为根本，法门殊胜。修药师法门的人切记多多帮助病苦的人，多多施药关心病人，如经所说而行。如法修持，获福无边。
二：药师法门是现生就能得福慧的法门。药师佛行菩萨道时发十二大愿，令我们发挥财富，所求皆得。
三：药师法门是最适合相貌不好的人修。有人一体身下劣诸根不具。丑陋顽愚，盲聋喑哑，挛躄背偻，白癞癫狂，种种病 苦。念南无药师琉璃光如来名号，来生就会长得非常美丽。
四：药师法门是最适合贫穷的人修。念南无药师琉璃光如来名号，很快就能得到财富。
五：药师法门是最适合病苦的人修。众人有病，一逼一切无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。念南无药师琉璃光如来名字，一经其耳，众病悉得除身心安乐，家属资具悉皆丰足。乃至证得无上菩提。
六：药师法门是最适合诸事不顺的人修。众生心中随所乐求，一切皆遂。求长寿得长寿。求富饶得富饶。求官位得官位。求男一女得男一女 。
七：药师法门是最适合一心求生极乐世界，而没有把握的人修。有人愿生西方极乐世界无量寿佛所。听闻正法，而未定者。修学药师法门，临命终时有八菩萨。乘神通来示其道路，即于彼界种种杂色众宝华中自然化生。易得弥陀本愿海，唯修药师本愿海。
八：药师法门是最适合持戒不严的人修。有人学习如来正法。而破戒律。有虽不破戒律而破轨则。有于戒律轨则虽得不坏，听到药师琉璃光如来名号。便舍恶行修诸善法。不堕恶趣。设有不能舍诸恶行，修行善法。堕恶趣者。由于如来本愿威力。令其现前暂闻名号。从彼命终还生人趣。得正见一精一进善调意乐。
九：药师法门是最适合灾难重重的人修。灾难起时，所谓人众疾疫难，外国侵一逼一难，国家政变难，星宿变怪难，日月薄蚀难，非时风雨难，过时不雨难。如果能供养药师琉璃光如来，众难解脱。
十：修药师法门，不会九横死，不会中邪，因为有药叉菩萨保护。
十一：若是女人讨厌女人身，听到世尊药师如来名号，至心称念，于后不复更受女身。
十二： 修药师法门，聪明智慧，勇健威猛，如大力士，速成佛道。