1、身体原因
(1)某些胃肠道疾病的影响：消化性溃疡、急慢性肝炎、慢性肠炎以及各种原因的腹泻及慢性便秘等都可能会引起小儿厌食症，应具体排查找到原疾病；(
(2)某些药物的副作用会引起消化道变态反应，易引起恶心、呕吐等，如红霉素、氯霉素、磺胺类药物以及氨茶碱等药物会导致食欲不振，厌食。维生素A或维生素D中毒也表现有厌食。一些抗癌药物更容易引起厌食。
(3)身体缺乏某种微量元素及某些内分泌素不足也有可能引起厌食。如缺锌常表现有厌食，某些内分泌素如甲状腺功能低下、肾上腺皮质激素相对不足也可表现厌食。
(4)全身性疾病如结核病、胶原病、贫血、及一些慢性感染等。
(5)其他如肝功能不全、高血压、酸中毒、尿毒症、以及心功能不全消化道淤血。
2、父母方面的原因
(1)喂养不当
因为家庭经济改善、市场儿童零食供应增多，小孩子容易受不了诱惑乱吃零食，高蛋白、高糖的饮食使食欲下降，两餐之间随意吃糖果、点心、花生、瓜子等零食，以及吃饭不定时、生活不规律都影响食欲；
(2)错误教育的影响
家长对儿童要求过高，限制自由，阻止与其他儿童玩耍，或限制他想去的地方，影响其情绪，使食欲降低。家长过分注意儿童进食，容易因为一次的进食不成功而对孩子发脾气，反复诱导或以威胁手段使小儿容易患上厌食症；
(3)家长本身有厌食偏食的习惯
给孩子留下不良的印象。
3、小儿情绪的影响
(1)因家长溺爱对小儿进食采取不适当的态度，反而引起神经性厌食。
(2)夏季气候过热，湿度过高以及过多的冷饮都影响消化液的分泌，而影响食欲。
(3)急性精神刺激：如小儿受到强烈惊吓之后，精神萎靡、活动受抑制，食欲降低。这种厌食，往往时间不会太长，恐吓心理过去食欲也就会恢复。
(4)亚急性或慢性精神刺激：离开亲人及熟悉的环境进入托儿所或其他新环境时，对新环境不适应，情绪低落，食欲降低。家庭不幸或父母离异等情况都有可能是厌食症的原因。