大明王朝的开国皇帝朱元璋，本是佛祖的门徒，但对风神、水神这类自然神灵也颇崇拜，信神信鬼。
《明史·方伎传》(卷299)记载，朱元璋在与陈友谅的较量中，便请术士张中祭过风神。张中，“少应进士举不第，遂放情山水。遇异人，授数学，谈祸福，多奇中。”
朱元璋兵下南昌时，军中总管邓愈推荐了此人，之后朱元璋常将张中带在身边。陈友谅围攻南昌时，朱元璋前去讨伐，问惑于张中。张中告诉朱元璋，50天内，必能抓获敌方将领。朱元璋遂将其带着一起参战，兵船到了孤山，没有风无法前行，张中“乃以洞玄法祭之，风大作，遂达鄱阳。”在这场战役中，朱元璋降服了5万敌人，陈友谅在被流箭射中而死，朱元璋消灭了一个重要争夺江山对手，奠定立国的胜局。
朱元璋甚至迷信到为一根桅杆建祠的地步。明代吴中四才子之一的祝允明，在其所撰《野记》中，记录了当年的传说：朱元璋当年渡江时，眼看船就要翻了，一根桅杆救了他的命。为此，朱元璋命令将这根桅杆供奉起来，并订立祭祀制度。此祠在南京城西的清凉门外，140年后还有人住在祠旁看守，据说这是当年给朱元璋撑船士兵的后人。
朱元璋为什么这么相信神灵？据说与他起兵时抽到的一则签语有关。明人郎瑛所撰《七修类稿》称，朱元璋渡江时，桅杆折了，见江东一神庙里有一根木头可以代替，便要砍伐。庙里的师傅见状，请朱元璋抽一签，看签上怎么说。遂得一签语：“世间万物皆有主，非义一毫君莫取。总然豪杰自天生，也须步步循规矩。”朱元璋见签便不敢再砍伐了。
朱元璋迷信到兴工动土时也要祭祀。今南京城南的中华门，这名字是后起的，不过几十年时间，原名叫“聚宝门”。为什将都城的正南门取此名？明人谢肇淛在其所撰《五杂俎·地部一》(卷3)中记录了这样的说法，“相传洪武初沈万三所筑也。沈之富甲于江南，太祖令筑东南诸城，西北者未就而沈工已竣矣。太祖屡欲杀之。人言其家有聚宝盆，故能致富，沈遂声言以盆埋城门下以镇王气，故以名门云。”
把人家的聚宝盆填埋到自己的城门下，可能不少人会觉得有趣，而下面一则关于朱元璋祭神的传说就不那么浪漫了。
明朝在南京的皇宫是颇通堪舆术的“诚意伯”刘基卜选的，处于钟山的西南脚边。早在至正二十六年八月，朱元璋称吴不久，便下令拓建应天城(南京)，刘基是重要的卜选人。经卜，决定在旧应天城东面白下门外2里多的地方增筑新城，并建“吴王新宫”。吴王新宫即后来的明皇宫。新宫次年九月即告完工，速度非常快。
但营建的过程非常不顺。这地方原来是一处低洼的水塘——燕雀湖，为填此湖费了老劲，朱元璋曾调集了几十万民工前来填湖。民间传说，填湖前，朱元璋进行了“祭湖”活动，希望不要得罪了湖神。
由于燕雀湖面积很大，一时难以填好，朱元璋以为湖神生气了。朱元璋便想祭祀“湖神”。听说城南的江宁县(今江宁区)有一位叫田德满的老人，朱元璋便封其为“湖神”，将他捆绑起来投进湖底。说来也怪，此后工程加快，很快燕雀湖就填满了，至今南京还有“湖神田德满”一说。如果这是真实的话，朱元璋在商周时间“奠基牲”的基础上，又发明了“垫湖牲”，这是十分恐怖的。
朱元璋生前迷信鬼神，当然也疑神疑鬼。这里还有一个说法，湖填好后，工匠为新宫地基放线，朱元璋一看前方地势不够开阔，便将基桩向后挪了一下，问刘基这样是否可行。刘基告诉他当然行，“但这样一挪，将来不免迁都”。朱元璋本来就打算迁都，也未在意。城墙建好后，异常高大坚固(至今尚存)，朱元璋又问刘基，这样的城墙谁人能越过，刘基说，“只有燕子可以越过”。朱元璋高兴之余心里也在寻思，难道第四子、被分封在北京的燕王将来会起事？果然，朱元璋死后朱棣兴兵，攻下了应天城当了皇帝，“燕子”越过了城墙。实际上，由于南京的皇宫是填湖造出来的，前高后低，下沉严重，几年后新宫便出现裂缝，生性多疑的朱元璋为此犯下心病，致死未解。
朱元璋的崇神情结影响了子孙帝王，明史上有多处记载后来的皇帝派员祭祀风神、海神、江神等神灵的文字。如：
《明史·宪宗本纪》(卷13)：“七年闰九月己未，浙江潮溢，漂民居、盐场，遣工部侍郎李颙往祭海神，修筑堤岸。”
《明史·世宗本纪一》(卷17)：“二十年三月己巳，渡河，祭大河之神。”
《明史·世宗本纪二》(卷18)：“三十四年春正月丁酉朔，倭陷崇德，攻德清。二月丙戌，工部侍郎赵文华祭海，兼区处防倭。”
当然，明朝对“海神”比较重视，这可能与明朝对外交往也有关系，如明初郑和七次下西洋，次次出航归航都要祭海神，还在今南京下关修建了海神庙——天妃宫，几年前，南京还修复了此宫。