清初的皇帝们，其婚姻充满了政治色彩。努尔哈赤的妻妾见于史籍记载的共有十四人。其中七位妻妾的纳娶，是政治联盟的结果。而其余的妻妾，也大多来自不同的部落。清初满蒙政治联姻盛行，据《清皇室四谱》第二卷记载，清太宗皇太极有蒙古妻七人，占其后妃总数的一半左右;清世祖福临有蒙古妻六人，占其后妃总数的三分之一。
皇太极有名号的后妃共有十五人，在这十五位后妃中，有七位来自蒙古草原。其中地位最为尊贵的“崇德五宫后妃”，全部是蒙古族女子，并且有两位是寡妇。更有三位出自科尔沁部——莽古思一门姑姑侄女三人同嫁一夫皇太极。皇太极的婚姻之奇还不止于此，他还曾令已经为他生过两个女儿的侧妃博尔济吉特氏改嫁他人。那么，贵为天子的皇太极为何娶俩寡妇呢？原来，这两个女人的身份很特殊，她们都是众蒙古部落之主察哈尔林丹汗的妻子，她们是在林丹汗死后来投奔皇太极的，先后在后金天聪八年(1634年)和天聪九年(1635年)，被皇太极纳入宫中收为己有。
1632年，皇太极亲率八旗大军会同蒙古诸部，大举进攻林丹汗所部察哈尔军，激战之下，林丹汗所部伤亡大半，林丹汗大败后逃往青海草原，两年后的1634年，众叛亲离的林丹汗病死在青海，他的部下逐渐土崩瓦解，他的福晋们也开始寻找自己新的归宿。1634年8月，林丹汗的后妃之一窦土门福晋，由一名叫多尼库鲁克的护送下，率一行人到皇太极的军营行幄，表示归顺，并选择了木湖尔伊济牙尔地方暂时驻牧。其实当时窦土门福晋很想嫁给皇太极，只是自己无法启齿。善解人意的大贝勒代善见状，自然明白来者的心意，便到皇太极面前说，此女乃上天所赐，应该把她纳为妃子。
窦土门福晋楚楚动人，皇太极对这位送上门来的美丽女子也很中意，只是担心外界会说他们发动的这场战争是为了夺人家的妻子，名声不好，故而再三推托。大贝勒代善忙说：“不会，相反，我们这样做，还会争取一部分蒙古人投降，成为我们的盟军。”而贝勒们也认为：这样做，有利于收降林丹汗手下部众，这也是政治上的需要。
皇太极动心了，考虑了三天后，最后决定娶窦土门。皇太极还对诸贝勒大臣谈到了他的一次奇遇：他一次行军途中驻跸于纳里特河时，曾有一只雌雉飞入他的御幄。在他看来，这就是美女入帐的“吉兆”，窦土门福晋来归嫁是“天作之合”，既然是上天的旨意，那就要接受了。皇太极于是派巴克什希福等前往迎接，护送窦土门福晋的多尼库鲁克非常高兴，说他们此来的目的，就是为送福晋给皇太极的，说完望天拜谢。多尼库鲁克的使命完成了，他也归降了皇太极为其效忠。
在皇太极纳娶窦土门福晋后不到一年，1635年3月，林丹汗的多罗大福晋，即嫡妻囊囊太后娜木钟率领一千五百户部众来归;4月，林丹汗另一个大福晋苏泰太后和她的儿子额哲，即林丹汗的继承人，又率一千户部众来投，并献上历代传国玉玺;随同两位尊贵太后前来的还有林丹汗另两位侧室福晋伯奇太后、俄尔哲依图太后及林丹汗的妹妹泰松公主等。
在这些女子当中，如果论资格地位，囊囊太后排在第一位，她不仅出身蒙古郡王之家，而且是林丹汗的“正宫娘娘”。那么，让谁来娶尊贵的囊囊太后呢？当然只能是地位最高的皇太极。皇太极开始时也是推辞此事。但在众贝勒的坚持接纳之下，皇太极只好答应了，将其迎入城内隆重迎娶。由于娜木钟地位尊贵，故在公元1636年，即清崇德元年册封后妃时，被封为西宫麟趾宫贵妃，而比她早一年归嫁皇太极的窦土门福晋，因地位不及娜木钟，被封为次东宫衍庆宫淑妃，而早在公元1625年就已嫁给皇太极的原西宫妃布木布泰，则退居为次西宫，封永福宫庄妃。
蒙古的科尔沁部归附后金最早。科尔沁部左翼首领、明安贝勒之兄莽古思于公元1614年将女儿送与皇太极为妻，这就是皇太极的中宫皇后孝端文皇后，也称为哲哲皇后。满蒙联姻，进一步促进了其政治上的稳定关系。1629年，皇太极起兵征明，科尔沁部二十三位贝勒率领部众追随，为击败明军立下了赫赫战功。
1625年，科尔沁贝勒宰桑之子吴克善送呈妹妹布木布泰与皇太极为妃，即后来在历史上大名鼎鼎的庄妃。宰桑贝勒是莽古思之子、中宫皇后的兄弟，因此庄妃是皇太极中宫皇后的亲侄女。庄妃是顺治皇帝福临的生母，她一生经历清初三朝，正是由乱到治的关键历史时期。她全力辅佐皇帝，对调和清宫内部矛盾和斗争，稳定清初社会秩序，为促进国家的统一作出了重大贡献。后世称之为“清代国母”。1634年，吴克善又送一妹至沈阳与皇太极为妃，这次送来的是庄妃的胞姐海兰珠，被皇太极纳为宸妃。至此，莽古思一门姑姑侄女三人同嫁一夫皇太极。
宸妃海兰珠是皇太极的最爱，他以《诗经》中象征爱情的诗句：“关关雎鸠，在河之洲，窈窕淑女，君子好逑”，将宸妃居住的寝宫命名为“关雎宫”。宸妃的地位在五宫中位居第二，仅次于其姑母孝端皇后。但天妒红颜，宸妃海兰珠在三十三岁就病故了。皇太极为此悲恸欲绝，寝食俱废，乃至昏死过去，经紧急抢救，才渐渐苏醒过来。皇太极为宸妃举行了隆重的丧礼，赐谥号为敏惠恭和元妃，这是清代妃子谥号中字数最多的。自从失去宸妃，皇太极朝夕悲痛，饮食顿减，身体每况愈下，还常常“言语无绪”。后来，诸王大臣请他去到蒲河射猎，借以消愁解闷。不想，路过宸妃墓，触景伤情，又引得他大哭一场。宸妃死后不到两年，皇太极也命归九泉了。皇太极对宸妃这种真情笃意，在历朝皇帝中都是少见的。
满清政权初期，儒家的那一套尚未完全占领其执政者的头脑。在皇太极的后妃中，一个已经为他生过两个女儿的侧妃——蒙古扎鲁特部代青贝勒之女博尔济吉特氏却被皇太极命令改嫁他人，嫁给了叶赫部的德尔格尔台吉之子南褚为妻。史载：“汗之第三福晋扎鲁特部巴雅尔图代青之女因不合汗意，给了叶赫部的德尔格尔台吉之子南褚。”皇太极作为一代帝王，却做出令自己的妾妃改嫁的事情，令人匪夷所思，这在中国的封建帝王中是罕见的。