一、外涂药物法：
此法可作为该病的辅助疗法或患处损害较小时的治疗方法。
①用10%的碘酒、6%的水杨酸、30%的冰醋酸外涂：可选用上述三种涂液中的任何一种，每日涂病甲1～2次，用药前应先把病甲刮保可坚持涂药至新甲长出，一般需治疗3～6个月。（涂药时应避免将药液涂到甲周皮肤上，以免损伤皮肤）。
②用8%的环吡酮胺软膏外涂：每日涂抹病甲2次，可坚持涂药至新甲长出，一般需治疗3-6个月。
二、内服药物法：
此法适用于病甲损害严重、病甲较多和局部用药效果不佳者。
目前，临床医生常推荐用如下三种口服抗真菌药物来治疗甲癣：
①伊曲康唑（斯皮仁诺胶囊）：使用该药可采用冲击疗法，即每日口服200毫克，可在早晚餐后各服一粒，以连续服药1周后停药3周为一个疗程。如果是灰指甲，两个疗程即可治愈，如果是灰趾甲，则需三个疗程。如果用该药治疗皮肤真菌感染，一般只需一个冲击疗程即可治愈。
②氟康唑（大扶康）：每日口服150毫克，一般需连续服用3～6个月。
内服药物法的优点是可由内向外地治疗疾病，避免了每天涂药的烦恼，轻松方便，同时口服药还可对于足癣、体癣、股癣、头癣等一并治疗。以上三种药物在我国已上市十多年，临床应用广泛，疗效确定。其中，服用斯皮仁诺胶囊一周后，药物就可直接到达指（趾）甲。停服该药后当患者的血液是几乎没有该药存在时，其指(趾)甲中的药物却会持续存在，这样就大大提高了口服该药的有效性;服药治疗的缺点是花费相对较高，部分患者会出现不良反应，所以，患者最好应在医生的指导下服药，尤其是患有肝脏疾病者及孕妇、哺乳期妇女应避免服用上述药物。
三、外科拔甲法：
此法适用于单发的灰指甲。外科医生可在为患者进行局部麻醉的情况下拔除其患病的指（趾）甲。此外，还可以应用化学药物拔除病甲。如使用40%的尿素软膏包裹病甲，每日换药一次，一般换药5—7次后，患病的甲板即可软化并与甲床分离，此时便可将病甲拔除。此法的优点是治疗灰指甲比较彻底;其缺点是患者的痛苦较大，且可能为患者的日常生活带来不便。所以，此法目前极少应用，仅在病情严重，使用其他治疗方法无效时才考虑使用。