古人论疟不离乎肝胆，亦犹咳不离乎肺也
寒热往来名曰疟，正气与邪相击搏。风寒暑湿食与痰，亦有阴虚兼气弱。阳分日发邪气轻，阴分深兮间日作。在气早临（气分）血晏临（血分），于阳为热寒为阴。并则寒热离则止（暑气邪气与营卫并行则疟作，离则疟止），营卫邪气交相争。邪不胜正到时早（邪达于阳病退），正不胜邪移晚行（邪陷于阴，病进）。总因感邪汗不泄，汗闭不泄痰郁成。痰郁不散发寒热，要看受病久与新。新疟宜泄宜发散，久疟补气和滋阴。无痰无食不成疟，初起饮服清脾灵。自汗去半加知料，无汗加苍干葛吞。多热黄芩知母进，多寒薄桂胥堪增。头痛川芎羌芷要，烦渴不眠粉葛凭。夏月香薷白扁豆，冬天无汗麻黄应。若既日久精神倦，六脉细微出盗汗。滋阴鳖甲归芍佳，补气参 洵称善。清脾饮除果浓朴，姜枣加之病渐痊。又生疟母左胁间，令人多汗胁痛连。治宜消导用何药，鳖甲棱蓬附四般。醋煎停匀加海粉，桃青芽曲红花兼。为末和丸日三服，块当化散不为艰。
暑热宜专理上焦肺脏清气
桂枝白虎汤 天水散
湿邪宜治脾胃中焦阳气
藿香正气散 二陈汤去甘草 加杏仁、白蔻、生姜。
足太阳脾虚，面浮胀满
通补用理中汤 人参 白术 甘草 干姜 开腑用五苓散 术 桂 茯 猪 泽
足少阴肾痿弱成劳，宜滋阴温养
复脉汤 人参 炙草 桂枝 麻仁 生地 阿胶 麦冬 生姜 大枣
足厥阴肝厥逆吐蛔及邪结疟母
乌梅丸
鳖甲煎丸 鳖甲 黄芩 鼠妇 大黄 桂枝 石苇 乌扇 柴胡 干姜 芍药 葶苈 川朴 丹皮 瞿麦 紫葳 半夏 人参 阿胶 虫 蜂窠 赤硝 羌琅 桃仁 清酒 灶下灰
又瘅疟，但热不寒（宜甘寒生津，重后天胃气，治在肺经）
生地 元参 花粉 薄荷 蔗汁 西瓜翠 麦冬 知母 杏仁 贝母 梨汁 鲜竹叶
脾胃阳虚，腹胀，舌白不喜饮
于术 人参 半夏 茯苓 生姜 浓朴 知母 杏仁 草果
阴虚热伏血分
熟地 白芍 五味 山药 茯苓 芡实 莲子 鳖甲 知母 草果 生地 桃仁 花粉 青蒿 首乌 丹皮 龟板 泽泻 炙草 桑叶 天冬
六味丸 清骨散 银柴胡 胡黄连 秦艽 地骨皮 鳖甲苏 青蒿 知母 粉甘草
暑热拒格三焦，呕逆不纳
宗半夏泻心法 半夏 黄芩 炙草 大枣 川连 人参 干姜
胃虚呕逆
旋复代赭汤
热结痞结
半夏 人参 茯苓 川连 枳实 姜汁
疟兼热痢
人参 干姜 广皮 归身 枳实 川连 银花 黄芩 白芍 山楂
心经疟热，多神昏谵语，舌边赤，心黄，防痉厥
犀角 元参 竹叶 连翘 麦冬 银花
救逆汤 桂枝 炙草 干姜 枣子 蜀膝 龙骨 牡蛎 此方去干姜加白芍可参用
心经疟久动及其营，必烦渴见红，宜滋阴法。
肺经疟久伤及其津，必胃闭肺痹，宜清降法。
陈曰∶疟发久邪必入络，络属血分，汗下两者未能逐邪。仲景制鳖甲煎丸治络聚血邪，久则血下，温疟例忌足六经药，如柴葛之类，用桂枝白虎汤主之。古称三阴大疟，以肝脾肾三脏之见证为要领。阳疟之后养胃阴，阴疟之后理脾阳主之。太阳经行身之背，疟发背冷不由四肢，是少阴之阳不营太阳。