少师曰：命门居水火中，属水乎?属火乎?岐伯曰：命门，火也。无形有气，居两肾之间，能生水而亦藏于水也。少师曰：藏于水以生水，何也?岐伯曰：火非水不藏，无水则火沸矣。；水非火不生，无火则水绝矣。水与火盖两相生而两相藏也。少师曰：命门之火，既与两肾相亲宜与各脏腑疏矣。岐伯曰：命门为十二经之主。不止肾恃之为根，各脏腑无不相合也。少师曰：十二经皆有火也，何藉命门之生乎?岐伯曰：十二经之火，皆后天之火也。后天之火非先天之火不化。十二经之火得命门先天之火则生生不息，而后可转输运动变化于无穷，此十二经所以皆仰望于命门，各倚之为根也。少师曰：命门之火气甚微，十二经皆来取资，尽为分给，不虞匮乏乎?岐伯曰：命门居水火中，水火相济，取之正无穷也。少师曰：水火非出于肾乎?岐伯曰：命门水火虽不全属于肾，亦不全离乎肾也。盖各经之水火均属后天，独肾中水火则属先天也。后天火易旺，先天火易衰。故命门火微，必须补火，而补火必须补肾，又必兼水火。补之正，以命门之火可旺，而不可过旺也。火之过旺，水之过衰也。水衰不能济火，则火无所制，必焚沸于十二经，不受益而受损矣。故补火必须于水中补之。水中补火则命门与两肾有既济之欢，分布于十二经亦无未济之害也。少师曰，命门之系人生死甚重，《内经》何以遗之?岐伯曰：未尝遗也。主不明则十二官危。所谓主者，正指命门也。七节之旁有小心。小心者，亦指命门也。人特未悟耳。少师曰：命门为主，前人未言何也，岐伯曰：广成子云：窃窈冥冥，其中有神。恍恍惚惚，其中有气。亦指命门也。谁谓前人勿道哉。且命门居于肾，通于任督，更与丹田神室相接。存神于丹田，所以温命门也。守气于神室，所以养命门也。修仙之道无非温养命门耳。命门旺而十二经皆旺，命门衰而十二经皆衰也。命门生而气生，命门绝而气绝矣。少师曰：善。
陈士铎曰：命门为十二经之主。《素问》不明言者，以主之难识耳。然不明言者，未尝不显言之也。无如世人不悟耳。经天师指示而命门绝而不绝矣。秦火未焚之前，何故修命门者少，总由于不善读《内经》也。
凌波按：以何处为命门，是颇值得研究的，有说此有说彼，其实命门一处本无定处。在人与天地同其德时，自可见命门，其他一切都是空谈。若只说长生，则立鼎之处即是命门，即在脐后肾前。